개인사업자연말정산 환급 공제 기간 의료비 환급금 인적 세금 서류 방법

개인사업자 연말정산 기간은 따로 없고 다음 해 5월 종합소득세 신고 기간에 정산합니다

연말정산은 회사(원천징수의무자)가 근로자의 1년치 세금을 2월에 정산하는 절차입니다. 개인사업자의 사업소득은 이 절차가 없어서, 종합소득이 있는 사람은 다음 해 5월 1일부터 5월 31일까지 종합소득세 확정신고로 정산합니다(소득세법 제70조).

국세청은 2025년 귀속분 신고기한을 2026년 6월 1일로 안내했습니다.

수입금액이 업종별 기준 이상인 성실신고확인대상자는 세무사 등이 확인한 성실신고확인서를 붙여 다음 해 6월 30일까지 신고합니다(소득세법 제70조의2). 기준은 농업·도소매 등 15억원, 제조·숙박·음식점 등 7억 5천만원, 부동산임대·전문서비스·교육·보건 등 5억원입니다(시행령 제133조).

2월에 정산하는 예외는 두 가지입니다. 보험모집인·방문판매원·음료배달판매원은 지급처가 2월분 수당을 줄 때 사업소득을 연말정산하고, 직원을 둔 사장님은 2월분 급여를 줄 때 직원 근로소득을 연말정산합니다.

2025년 귀속분은 2026년 6월 1일까지 신고했습니다(국세청). 2026년 귀속분 날짜는 2027년 국세청 공지로 확인하세요.

보험모집인·방문판매원·음료배달판매원만 2월에 사업소득 연말정산을 합니다

개인사업자 가운데 지급처가 연말정산을 해 주는 경우는 간편장부대상자인 보험모집인, 방문판매원, 음료배달판매원뿐입니다(소득세법 시행령 제137조). 간편장부대상자는 해당 연도에 새로 사업을 시작했거나 이 사업소득만 있으면서 직전 연도 수입금액이 7,500만원 미만인 사람입니다(국세청).

지급처는 다음 해 2월분 수당을 줄 때(2월분이 없으면 2월 말일, 계약을 끝내면 그 달) 1년치 수입금액에 소득률(1 − 단순경비율)을 곱해 소득금액을 계산하고, 인적공제 등을 빼서 세금을 다시 계산합니다. 이미 원천징수한 세금이 많으면 돌려주고, 모자라면 더 걷으며 10만원을 넘으면 2~4월분에 나누어 걷을 수 있습니다(소득세법 제144조의2).

이 사업소득만 있고 연말정산을 마쳤다면 5월 종합소득세 신고를 하지 않아도 됩니다(소득세법 제73조). 방문판매원·음료배달판매원은 지급처가 처음 연말정산하려는 해의 말일까지 사업소득세액연말정산 신청서를 세무서에 내고 실제로 연말정산을 한 경우에만 해당하므로(소득세법 시행령 제137조·제201조의11), 지급처에 연말정산 여부를 먼저 확인합니다.

개인사업자 연말정산 공제는 인적공제·국민연금·소상공인 공제부금·연금계좌가 중심입니다

개인사업자 연말정산 공제, 정확히는 종합소득세 신고 때 받는 공제는 근로자와 겹치는 것과 근로자만 받는 것이 나뉩니다. 인적공제(1명 150만원), 국민연금 같은 공적연금 보험료 공제(낸 금액 전액, 소득세법 제51조의3), 연금계좌세액공제, 자녀세액공제는 종합소득이 있는 사람이면 받습니다.

사업자만 받는 소득공제로 소기업·소상공인 공제부금 소득공제가 있습니다. 한 해 낸 공제부금을 사업소득금액 4천만원 이하 600만원, 6천만원 이하 500만원, 1억원 이하 400만원, 1억원 초과 200만원까지 사업소득금액에서 뺍니다(조세특례제한법 제86조의3).

부동산임대업 소득금액은 공제 대상에서 빠집니다.

보험료·의료비·교육비 세액공제와 신용카드 소득공제는 법에서 "근로소득이 있는 거주자"로 정해 일반 개인사업자는 받을 수 없습니다(소득세법 제59조의4, 조세특례제한법 제126조의2). 대신 표준세액공제 연 7만원을 받고, 사업용계좌 신고 등 요건을 갖춘 성실사업자는 연 12만원입니다.

연금계좌세액공제율은 종합소득금액 4,500만원 이하 15%, 초과 12%입니다(소득세법 제59조의3).

개인사업자 연말정산 인적공제는 1명당 150만원이고 부양가족은 나이·소득 요건을 봅니다

인적공제는 근로자와 같은 소득세법 제50조·제51조를 따릅니다. 본인과 요건을 갖춘 배우자·부양가족 1명당 연 150만원을 종합소득금액에서 빼고, 부양가족은 연간 소득금액 합계가 100만원 이하(총급여 500만원 이하 근로소득만 있으면 포함)여야 합니다.

나이 요건은 부모 등 직계존속 60세 이상, 자녀 등 직계비속 20세 이하, 형제자매 20세 이하 또는 60세 이상이고, 장애인은 나이 제한이 없습니다. 같은 가족을 여러 사람이 동시에 공제받을 수는 없어 한 사람의 신고에서만 공제합니다(제50조 제3항).

추가공제는 70세 이상 1명당 100만원, 장애인 200만원, 배우자가 없는 사람이 기본공제 대상 자녀를 둔 한부모 100만원, 종합소득금액 3천만원 이하 부녀자 50만원입니다. 인적공제 합계가 종합소득금액보다 크면 넘는 부분은 없어집니다(제51조).

개인사업자 연말정산 의료비는 성실사업자와 성실신고확인서 제출자만 15% 공제됩니다

의료비 세액공제는 소득세법 제59조의4에서 "근로소득이 있는 거주자"만 받도록 정해, 사업소득만 있는 개인사업자는 원칙적으로 받을 수 없습니다. 예외는 조세특례제한법 제122조의3의 성실사업자와 성실신고확인서를 낸 성실신고확인대상자입니다.

이들은 2026년 12월 31일이 속하는 과세연도까지 지출한 의료비·교육비의 15%(미숙아·선천성이상아 의료비 20%, 난임시술비 30%)를 사업소득에 대한 소득세에서 뺍니다. 의료비는 근로자 계산식을 따르되 총급여 대신 사업소득금액의 3%를 넘는 금액부터 공제합니다.

예를 들어 사업소득금액 4,000만원인 성실사업자가 본인 의료비 300만원을 썼다면 (300만원 − 120만원) × 15% = 27만원입니다.

월세도 같은 조문으로 종합소득금액 7천만원 이하면 15%, 4,500만원 이하면 17%를 연 1천만원 한도로 공제합니다(근로자 월세 공제와 같은 조세특례제한법 제95조의2의 월세액 요건). 공제받은 뒤 사업소득을 10%(성실사업자 20%) 이상 적게 신고한 것이 드러나면 공제액을 전액 추징하고 다음 3년 동안 이 공제를 받을 수 없습니다.

개인사업자 연말정산 세금은 6~45% 세율로 계산하고 미리 낸 세금이 많으면 환급합니다

개인사업자 세금은 수입금액에서 필요경비를 뺀 사업소득금액에 다른 종합소득을 더하고, 인적공제 등 소득공제를 뺀 과세표준에 세율을 곱해 계산합니다. 국세청이 안내하는 2023~2025년 귀속 세율은 과세표준 1,400만원 이하 6%부터 10억원 초과 45%까지 8단계이고, 세액은 "과세표준 × 세율 − 누진공제"입니다.

여기서 세액공제를 뺀 결정세액보다 1년 동안 원천징수 등으로 미리 낸 세금이 많으면 차액이 환급금이고, 적으면 신고기한까지 냅니다. 3.3%를 떼고 받은 프리랜서 수입이나 보험·방문판매 수당처럼 원천징수가 된 소득은 그 세금이 미리 낸 세금(기납부세액)으로 들어가 결정세액과 비교됩니다.

낼 세금이 1천만원을 넘으면 일부를 납부기한부터 2개월 안에 나누어 낼 수 있습니다.

환급금은 세무서가 환급을 결정한 날부터 30일 안에 지급합니다(국세기본법 제51조). 국세청은 2026년 신고분의 법정환급기한을 6월 30일로 안내했고, 모두채움(환급) 신고서를 고치지 않고 낸 사람에게는 6월 5일부터 지급한다고 안내했습니다.

홈택스에서 종합소득세 신고를 마치면 신고 내용이 위택스로 자동 연계되어 개인지방소득세까지 한 번에 신고할 수 있습니다.

예: 과세표준 3,000만원이면 3,000만원 × 15% − 126만원 = 324만원이 산출세액입니다. 여기에 세액공제를 빼고 미리 낸 세금과 비교합니다.

개인사업자 연말정산 방법은 홈택스 종합소득세 신고이고 장부와 공제 증명서류를 갖춥니다

신고는 홈택스 → 세금신고 → 종합소득세 신고에서 합니다. 국세청이 모두채움 안내문을 보냈다면 모두채움/단순경비율 신고에서 미리 채운 내용을 확인해 내고, 장부를 쓰거나 공제를 더 넣어야 하면 일반신고(모든신고안내유형)로 작성합니다.

같은 메뉴의 신고도움 서비스에서는 국세청이 자료를 준비한 납세자라면 맞춤형 신고도움자료와 절세혜택 안내를 볼 수 있습니다(2026년 신고 때 약 140만명 제공).

함께 내는 서류는 소득세법 제70조 제4항에 정해져 있습니다. 인적공제·연금보험료공제·특별세액공제 등의 증명서류, 수입금액과 필요경비 계산 서류, 장부를 썼다면 재무상태표·손익계산서 등(간편장부는 간편장부소득금액 계산서), 장부 없이 경비율로 계산했다면 추계소득금액 계산서입니다.

복식부기의무자가 재무제표를 내지 않으면 신고하지 않은 것으로 봅니다.

직원을 둔 사장님은 별도로 직원 근로소득을 2월분 급여 지급 때 연말정산하고(소득세법 제137조) 근로소득 지급명세서를 다음 해 3월 10일까지 냅니다(제164조). 신고한 뒤 빠뜨린 공제를 찾았다면 법정신고기한이 지난 뒤 5년 안에 경정청구로 바로잡을 수 있습니다(국세기본법 제45조의2).

1. 홈택스 로그인 → 세금신고 → 종합소득세 신고로 들어갑니다.
2. 신고도움 서비스에서 신고 안내 자료와 절세혜택 안내를 확인합니다.
3. 모두채움/단순경비율 신고 또는 일반신고를 고릅니다.
4. 수입금액·필요경비, 인적공제 등 공제와 미리 낸 세금을 넣고 제출합니다.
5. 개인지방소득세는 위택스로 자동 연계된 신고를 마치고 납부·환급 계좌를 확인합니다.

자주 묻는 질문